Уми Мацудзаки – ученица старшей школы, живущая в поместье Кокеликот, пансионе с видом на порт Иокогамы. Ее мать Риоко, профессор медицины, учится в США. В ее отсутствие Уми управляет домом и присматривает за своими младшими братьями, сестрами и бабушкой. Каждое утро Уми поднимает сигнальные флаги с посланием «Я молюсь о безопасном путешествии». Однажды в школьной газете публикуют стихи о поднимаемых ей флагах. Сюн Казама, автор стихотворения, наблюдает за флагами с моря, когда едет в школу. Вскоре ребята встречаются, и между ними зарождаются чувства. Но фотография погибшего отца Уми подрубает эти чувства на корню...
Действие сюжета разворачивается в 1963 году, когда у главной героини, школьницы Уми Комацудзаки, погибает отец. История повествует о буднях Коматсудзаки после этого печального события, ее отношениях с членом школьной газеты, президентом студенческого совета и другими одноклассниками.